A ESAPL possui uma estrutura organizativa de apoio técnico, cultural e administrativo, às actividades para as quais está vocacionada ( ensino superior, I&D e apoio à comunidade), que tem a designação de SERVIÇOS. Esta estrutura divide-se em: serviços técnicos; serviços de documentação e relações exteriores; serviços administrativos e serviços académicos.
Os serviços técnicos, que incluem os serviços analíticos e os serviços agrários, são estruturas de grande importância e fundamentais para a escola, pois são a base e o suporte do ensino superior e da investigação que se realiza na ESAPL. Integram estes serviços os laboratórios e a exploração agrária.
Os serviços de documentação e relações exteriores, facultam aos alunos a mais variada bibliografia e a pesquisa bibliográfica através da Web, com ligação gratuita 24 horas por dia, e efectuam a divulgação da escola, dos seus cursos, projectos e actividades.
Os Serviços administrativos são a estrutura de retaguarda que exercem as actividades necessárias para o normal funcionamento da escola, designadamente ao nível da gestão financeira, recursos humanos, expediente, arquivo, tesouraria, economato, património, expediente e apoio logístico.
Os serviços académicos são de importância vital para qualquer escola pois a vida escolar dos alunos passa, e é tratada, por este serviço. Desde o ingresso até à obtenção de grau académico, todas as actividades escolares dos alunos são da responsabilidade destes serviços.